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《东南国防医药》创刊于1954年，曾用刊名《卫生防疫资料》《医学资料》《南京部队医药》，是由南京军区联勤部卫生部主管、南京军区医学科学技术委员会主办的综合性医学期刊。

据2020年3月《东南国防医药》官网显示，《东南国防医药》第十三届编委会有编委118人、青年编委25人、常务委员17人。

据2020年3月7日中国知网显示，《东南国防医药》共出版文献7398篇、总被下载345637次、总被引16009次，（2019版）复合影响因子为0.685、（2019版）综合影响因子为0.598。据2020年3月7日万方数据知识服务平台显示，《东南国防医药》共载文5172篇、基金论文量为834篇、被引量为15519次、下载量为140067次，2017年影响因子为1.13。

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